Elle dispose de quatre emplacements pour mémoire vive DDR2, de deux emplacements PCI Express à 16 voies, d'un emplacement à 1 voie et d'un emplacement PCI classique. Elle supporte la technologie multi-GPU d'AMD, le CrossFireX, mais pas le SLI de NVIDIA. On retrouve en outre six connecteurs Serial ATA associés à un contrôleur supportant le RAID 0, 1 et 5, un connecteur Serial ATA supplémentaire et un port eSATA sur le panneau arrière. Ces connecteurs sont complétés par 12 ports USB (dont 6 sur le panneau arrière), 2 ports Firewire 400 (dont un à l'arrière), un connecteur Gigabit Ethernet et des entrées/sorties audio analogiques et numériques pris en charge par une puce X-Fi.
Ciblant le haut de gamme, l'Asus Maximus II Gene est livrée avec un petit écran LCD de diagnostic externe, avec 3DMark 06 Advanced Edition et avec de nombreux logiciels maisons pour la gestion et la surveillance du système. Sa date de disponibilité et son prix n'ont pas encore été annoncés.