Parmi ceux-là, on peut citer la possibilité que les données de l'iPod soient corrompues lorsqu'on éjecte le baladeur. Des problèmes d'affichage des textes et des graphismes peuvent encore apparaître et la synchronisation des contacts peut ne pas fonctionner.
Par ailleurs, il est précisé que les iPod et iTunes sont toujours incompatibles avec les éditions 64 bits de Windows, qu'il soit question de Windows XP ou de Windows Vista. Les utilisateurs d'iPod et de Windows Vista vont donc devoir prendre encore leur mal en patience...