Etant donné que Microsoft prévoit de sortir sa version 64 bits de Windows pendant le second semestre 2001, les utilisateurs de l'Itanium devront se tourner vers le système d'exploitation Linux.
Celui-ci a déjà été utilisé par Compaq et ses stations de calcul 64 bits "Alpha", tandis que les actuelles versions de Windows n'ont jamais été capables d'exploiter comme il se doit un processeur 64 bits.
En effet, jusqu'à présent, les systèmes d'exploitation Microsoft fonctionnent autour d'un noyau 32 bits.