Utilisant le moteur de Doom 3 dans une version plus évoluée, le FPS de 3D Realms vous proposera en plus de son mode solo, un mode multijoueur qui profitera de tous les avantages du jeu. Ainsi, vous pourrez, par exemple, modifier la gravité, marcher sur les murs, ou encore utiliser le pouvoir des anciens avec le « Spirit mode ». Mais ce n'est pas tout, car dans Prey, la mort ne signifiera pas la fin de la partie. En effet, après avoir perdu toute votre énergie, vous entrerez dans un monde appelé « Death Realm ». Ici, vous devrez vous battre contre les forces du mal afin de regagner un peu de vie et d'énergie spirituelle. Ce sera le seul moyen de réintégrer votre corps d'humain.
