Pour la version 3.5 l'équipe s'était appuyée sur Windows Foundation Presentation et développé l'application en .NET. Plusieurs utilisateurs pointaient du doigt une lenteur ainsi qu'un mauvais rendu de la police. Evernote 4 pour Windows est désormais natif et écrit en C++. Cela se traduirait notamment par un temps de démarrage jusqu'à cinq fois plus rapide et une empreinte mémoire deux fois moins importante.
L'interface utilisateur a été modifiée et remise au goût du jour avec désormais une seul barre d'outils et donc un affichage optimisé pour la lecture des notes. Pour les mémos pris rapidement, il est possible d'activer la fonction "tiraille de notes" qui choisira automatiquement un titre en fonction des mots-clé du texte. De nouveaux outils permettront d'imprimer la totalité ou juste une partie d'une note. L'intégration aux logiciels tiers a également été renforcée avec par exemple la possibilité de capturer du contenu depuis Internet Explorer, Firefox mais aussi Outlook. Sur Windows 7, Evernote tire parti des jumplists de la barre des tâches et l'application est capable de géo-localiser chaque nouvelle entrée sous forme de libellés.
