Par contre, Mega entend les critiques sur l'impossibilité de modifier ou de récupérer son mot de passe. La plateforme prévoit ainsi d'intégrer prochainement un outil permettant de changer cette suite, si l'utilisateur le désire. Cette modification entraînera ensuite un nouveau chiffrement des données stockées.
Concernant la génération de la clé de chiffrement à proprement parler, Mega prévoit de proposer de nouveaux mécanismes afin de renforcer la sécurité du service. L'utilisateur pourra notamment ajouter d'autres paramètres que les mouvements de souris ou les frappes de clavier.
L'équipe de développement rappelle enfin que chaque utilisateur se doit d'utiliser un mot de passe suffisamment robuste afin qu'il ne puisse pas être potentiellement découvert. Un outil baptisé Megacracker a en effet affirmé qu'il est possible de retrouver cet élément à partir du lien de confirmation d'inscription.