L'un des premiers programmes à pouvoir exploiter le GP-GPU avec les puces ATI se nomme . Pour ceux qui l'ignorent, le projet Folding@Home est un programme de calculs distribués qui vise à étudier comment se « plient » les protéines. Les résultats de ces recherches devraient permettre de mieux comprendre certaines maladies comme le Cancer, la maladie d'Alzheimer, celle de la vache folle (ESB), celle de Creutzfeldt-Jakob ou celle de Parkinson. A l'heure actuelle, plus de 200 000 ordinateurs dans le monde utiliseraient Folding@Home pour aider la recherche scientifique et médicale.
En exploitant, le GP-GPU avec des puces comme l'ATI Radeon X1900 ou le Radeon X1950, l'université de Standford affirme que les performances sous Folding@Home peuvent être multipliées par 20 - 40 fois (en comparant par rapport à un Pentium 4 2,8 GHz). D'ores et déjà proposée en version beta, la version 5.05 de Folding@Home et les Cartes Graphiques à base de Radeon série X1900. Mais les chercheurs de Standford ont annoncé la disponibilité prochaine d'une version compatible avec les cartes X1800. Un client pour Playstation 3 serait également en train d'être développé (voir la brève PS3 et carte ATI pour du calcul distribué ?).
Concernant les puces NVIDIA, l'université de Standford affirme ne pas avoir réussi à développer une version spéciale de Folding@Home avec ces puces, bien que NVIDIA travaille depuis longtemps sur le GP-GPU et promet prochainement des annonces à ce sujet.
Outre cela, ATI et NVIDIA souhaitent également utiliser la puissance de leurs processeurs graphiques pour effectuer des calculs liés aux effets physiques dans les jeux 3D (voir les brèves Trois cartes dont une pour la physique chez ATI et Trois ports pour les cartes mères SLI Physics ?!).
